Relay Therapeutics が AWS を利用して創薬を加速
2020 年
Relay Therapeutics は、タンパク質の動きに対する比類のないインサイトを活用することにより、創薬プロセスを変革する精密医療企業です。ラボで有望な化合物をテストする前に、科学者は分子の宇宙を検討する必要があります。そこには、利用可能な出発点として 100 億近くの化合物が存在しています。これらの科学者は、この広範なセットを、生物学的標的に結合する可能性が最も高い 100〜200 個の化合物にまで絞り込む必要があります。
より多くの化合物を解析することで、ラボでのテストに適した分子が見つかる可能性が高まります。数千の CPU を備えた典型的なオンプレミスのデータセンターでは、10 億の化合物の解析に数か月かかる可能性があります。オンプレミスのデータセンターに十分な CPU をデプロイすることも、特に解析の「バースト性」のために、法外なコストが発生します。
数十億行のテーブルを並べ替えるのは簡単なことではありません。AWS のテクノロジーを利用することで、これらすべての情報を効率的に処理できるため、これまで可能であると考えられていたよりも早く患者に薬を届けるという最終的な目標に向けて努力することができます」
Pat Walters 氏
Relay Therapeutics、計算担当シニアバイスプレジデント
24 時間で数十億の分子を処理する
通常、従来の IT 環境では、製薬会社は事実上一度に数百万の化合物をスクリーニングします。Relay Therapeutics は、その数を数十億に拡大することを決意し、課題を解決するためにアマゾン ウェブ サービス (AWS) を利用することにしました。「他のクラウドプロバイダーよりも AWS を選択する主な要因は、当初から提供されているサポートです」と Relay Therapeutics の計算担当シニアバイスプレジデントである Pat Walters 氏は述べています。「そして、それは当社のプロセスをより効率的なものにし続けています」
科学者のための簡素化されたプロセス
同社は AWS でバーチャルスクリーニングも簡素化したため、科学者はオープンソーススクリプトを利用して AWS Batch で解析を開始できます。その後、科学者は、管理するインフラストラクチャがないサーバーレスクエリサービスである Amazon Athena を利用して、データを迅速に解析します。
コンピューティングコストを 50% 節約
次のステップ: 100 億の化合物を処理する
AWS のハイパフォーマンスコンピューティングソリューションを導入して以来、Relay Therapeutics は 50 億の化合物のスクリーニングを複数回実行してきました。AWS が提供するスケーラビリティにより、科学者は同じ移動タンパク質ターゲットの複数のスナップショットに対してスクリーニングを実行できます。
不可能を可能にする
Relay Therapeutics について
AWS のメリット
- 数か月間ではなく 1 日で 50 億の分子化合物を解析
- コンピューティングリソースのコストを 50% 削減
- 科学者が複雑な解析を簡単に実行することを実現
- 解析パラメータを検証して、クラウド費用の超過を回避
- 各解析ジョブの必要に応じてコンピューティングリソースをスケール
利用されている AWS のサービス
AWS Batch
AWS Batch を使用することにより、デベロッパー、科学者、エンジニアは、数十万件のバッチコンピューティングジョブを AWS で簡単かつ効率的に実行できます。
Amazon Athena
Amazon Athena がインタラクティブなクエリサービスで、Amazon S3 内のデータを標準 SQL を使用して簡単に分析できるようになります。
Amazon EC2 スポットインスタンス
Amazon EC2 スポットインスタンスを使うと、AWS クラウド内の使用されていない EC2 キャパシティーを活用できます。スポットインスタンスは、オンデマンド料金に比べ最大 90% の割引価格でご利用いただけます。
開始方法
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