Recursos do AWS HealthOmics
Documentação
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Guia do usuário
Aprenda a usar o AWS HealthOmics neste guia do desenvolvedor detalhado.
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Referência de API
Leia este guia de referência para APIs e parâmetros do AWS HealthOmics.
Ferramentas e tutoriais
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Ferramentas de código aberto para AWS HealthOmics
Repositório de código aberto no Github com ferramentas para trabalhar com o AWS HealthOmics.
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Tutoriais de código aberto para o AWS HealthOmics
Repositório de código aberto no Github com código de exemplo que demonstra como armazenar, processar e consultar conjuntos de dados genômicos e biológicos usando o AWS HealthOmics.
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WDL Linter para AWS HealthOmics
Imagem de contêiner hospedada em repositórios públicos do Amazon ECR que fornece recomendações gerais e específicas para definições de fluxo de trabalho da WDL para uso com o AWS HealthOmics.
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Amazon ECR Helper para AWS HealthOmics
Aplicativo CDK de código aberto que automatiza a migração de imagens de contêineres para uso com fluxos de trabalho do AWS HealthOmics.
Soluções
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Orientação para migração e armazenamento de dados de sequência com o AWS HealthOmics
Esta orientação demonstra como importar dados de sequência ômica do Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) para o AWS HealthOmics Storage.
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Orientação para análise de dados multimodais com os serviços AWS Health e ML
Esta orientação demonstra como configurar um framework completo para analisar dados multimodais de saúde e ciências biológicas (HCLS).
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Orientação para fluxos de trabalho de bioinformática na AWS
Esta orientação mostra como criar e executar fluxos de trabalho de bioinformática de nível de produção em grande escala e usar os serviços da AWS para automação, análise de fluxo de trabalho, armazenamento e observabilidade operacional e de custos.
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Orientação para o desenvolvimento de fluxo de trabalho de bioinformática usando DevOps na AWS
Esta orientação demonstra como configurar um pipeline de integração e entrega contínuas (CI/CD) para automatizar o ciclo de vida de seus fluxos de trabalho de bioinformática no AWS HealthOmics.
Novidades
AWS HealthOmics now supports DSL and Nextflow version detection
13/8/24
O AWS HealthOmics agora fornece informações adicionais para execuções de fluxos de trabalho
23/02/24
AWS HealthOmics agora oferece suporte ao fluxo de trabalho Ultima Genomics DeepVariant Ready2Run
02/05/24
Agora, o AWS HealthOmics está disponível na região Israel (Tel Aviv)
26/09/23
AWS HealthOmics agora fornece arquivamento e retenção da execução de fluxos de trabalho
30/08/23
AWS HealthOmics já oferece suporte ao versionamento de repositórios de anotações
15/08/23
AWS HealthOmics oferece suporte ao compartilhamento entre contas de lojas de análise ômica
15/8/23
Publicações do blog
Orquestrar vários fluxos de trabalho do AWS HealthOmics em escala
7/5/24
Armazenar dados ômicos de forma econômica em qualquer escala com o AWS HealthOmics
24/01/24
fMRI Data Preprocessing on AWS using AFNI and AWS HealthOmics
01/08/24
New Tools to Accelerate Workflow Migrations to AWS HealthOmics
13/12/23
Multimodal Data Analysis with AWS Health and Machine Learning Services
16/10/23
Secure Your Genomic Workflows and Data with AWS HealthOmics
10/09/23
AWS HealthOmics now supports Sentieon genomic analysis pipelines
15/05/23
Element Biosciences offers Bases2FASTQ as a Ready2Run workflow on AWS HealthOmics
15/05/23
Easily run NVIDIA Parabricks Ready2Run workflows on AWS HealthOmics
15/05/23
Part 2: Automated End-to-End Genomics Data Storage and Analysis using AWS HealthOmics
29/11/22
Part 1: Introducing AWS HealthOmics—from sequence data to insights, securely and at scale
29/11/22
Vídeos
AWS re:Invent 2023 — Inovação da Omics com a AWS HealthOmics: o caminho da Amgen para resultados mais rápidos
AWS re:Invent 2023 — Criação de uma plataforma de medicina de precisão usando o AWS HealthOmics
AWS HealthOmics End to End Workshop - Presentation (43:27)
AWS On Air ft. AWS HealthOmics & Open Data (20:07)
Using AWS HealthOmics for Genomics End-to-End (2:03:06)
AWS On Air ft. Ready2Run Workflows on AWS HealthOmics (26:34)
A fast walk through AWS HealthOmics (12:47)
Integrate and derive insights from multi-modal health data (Integre e derive insighs de dados de saúde multimodais) (44:37)
Transform omics data into insights with AWS HealthOmics (38:56)